Los programas de muestreo de las superficies de procesado de alimentos son esenciales para detectar y prevenir la contaminación con Listeria monocytogenes,  muy especialmente en el caso de los alimentos listos para el consumo. El Laboratorio de Referencia de la UE para Listeria monocytogenes y la agencia francesa ANSES han publicado la cuarta edición de la "Guia técnica sobre muestreo del área de procesamiento de alimentos y equipos para la detección de Listeria monocytogenes".

Un estudio realizado en la ciudad de Valencia evalúa la presencia de diversos protozoos parásitos, como Cryptosporidium y Giardia, en verduras y fresas de producción orgánica, y constata la necesidad de mejorar el control de estos microorganismos patógenos en alimentos.

El control y la prevención de Listeria monocytogenes en la industria cárnica, especialmente en productos RTE, es clave para prevenir casos de listeriosis. Las organizaciones QS e IFS han desarrollado conjuntamente una guia de apoyo para incorporar al APPCC de las empresas la prevención y el control de Listeria durante el sacrificio, deshuesado y procesamiento de productos cárnicos.

Campylobacter spp. es uno de los patógenos transmitidos por alimentos más relevantes en la UE, siendo el consumo de carne de aves de corral contaminadas el principal origen de las infecciones humanas. De Islandia llega una propuesta innovadora para reducir las bacterias presentes en las canales de las aves, mediante un enfriamiento rápido a base de hielo líquido.