El último informe anual de EFSA sobre zoonosis en la UE muestra que la Salmonella siguió siendo la causa más común de brotes de origen alimentario en 2018 y Campylobacter el principal causante de casos de toxiinfecciones alimentarias. Entre las zoonosis emergentes destacó el año pasado el elevado número de infecciones por el Virus del Nilo Occidental y del informe destaca también el incremento de infecciones por E. coli productora de toxina Shiga (STEC).

Los alimentos con un bajo contenido de humedad, como cereales o frutos secos, se han considerado tradicionalmente seguros en cuanto a la contaminación microbiana, ya que la mayoria de bacterias necesitan una actividad de agua (Aw) mayor para poder crecer. Sin embargo, desde el 2001 se han detectado numerosos brotes alimentarios, principalmente causados por Salmonella spp.,  asociados a su consumo. El Codex Alimentarius establece Buenas Prácticas de Higiene y Producción para controlar este riesgo.

La CE ha actualizado cuatro Reglamentos dirigidos a controlar de forma armonizada el objetivo de la UE de reducir la prevalencia de determinados tipos de Salmonella en gallinas ponedoras, pollos de engorde, pavos y manadas reproductoras.  Los cambios se aplican en lo que se refiere a los métodos de muestreo y al uso de métodos de ensayo alternativos validados.

La colibacilosis aviar, producida por la bacteria E.coli, y la salmonelosis estan entre las principales infecciones bacterianas que afectan al sector avícola, con un fuerte impacto económico y en la seguridad alimentaria. El proyecto europeo PhagoVet responde a la necesidad del mercado de una solución segura y eficiente para controlar estas infecciones, minimizando el uso de los antibióticos. La propuesta se basa en el uso de bacteriófagos.